La heterogeneidad ambiental es un factor determinante en la evolución de la plasticidad fenotípica de los organismos. Los ambientes marcadamente heterogéneos son escenarios ideales para investigar los procesos y mecanismos de adaptación. Para diversos taxa, existe un importante cúmulo de evidencia sobre la influencia de la variación geográfica en los rasgos morfológicos, conductuales y de historia de vida. Sin embargo, pocos estudios han examinado las bases genéticas de esta variación, y más escasos aún aquellos que han indagado en los patrones de expresión genética asociados a la adaptación. Esos estudios, mayoritariamente relacionan la existencia de variación geográfica con genes candidatos a selección direccional. El objetivo de este trabajo es documentar las aproximaciones genómicas existentes para la identificación de genes asociados al proceso de adaptación local en ectotermos, evidenciando su potencial uso en la búsqueda de genes candidatos para el estudio de los mecanismos adaptativos en herpetozoos.