Este estudio busca describir las actitudes y percepciones de estudiantes y profesores universitarios sobre ansiedad y depresión en el aprendizaje virtual en tiempos de pandemia. Se aplica un cuestionario cuantitativo a una muestra no probabilística de estudiantes y profesores universitarios de El Salvador. Se realiza un análisis factorial exploratorio y se examinan diferencias estadísticamente significativas. Los resultados muestran diferencias según rol y dependencia de la universidad. No se encuentran diferencias significativas según entorno virtual. Se observa que las políticas, estrategias y acciones universitarias deben considerar las características sociodemográficas de estudiantes y profesores a fin de garantizar el abordaje integral y eficaz de condiciones de ansiedad y depresión en la comunidad académica. Se concluye que los problemas psicológicos de ansiedad y depresión manifestados por los estudiantes y profesores que participan en educación virtual durante la pandemia COVID-19 no están asociados significativamente a los entornos virtuales.